Trong lúc Trịnh Toàn đại chiến Bình Hồ, thì tỳ tướng là Hào quận công Lê Thì Hiến được lệnh hành quân theo thượng đạo, tới địa phận sông Ngàn Sâu ở xã An Việt Thượng. Chỗ này vốn có thủy quân của Trấn thủ Dương Trí của Đàng Trong đậu lại. Lê Thì Hiến thấy quân địch có ba mươi chiếc thuyền, bèn tung quân đánh gấp. Quân Nguyễn thua to. Thì Hiến bắt được một số thuyền, đem về dâng công tại Vĩnh Doanh.
Trịnh Toàn mở được đường thoát qua sông Lam, lại nghe tin quân Nguyễn dọa sẽ qua sông, chẹn đường Eo Ống. Trịnh Toàn vội đưa quân về An Trường, làm tờ khải báo tin chiến thắng.
Tháng Năm nhuận, chúa Trịnh Tráng tiếp được tin báo tiệp. Chúa liền luận công thắng trận Đại Nại, tiến hành phong thưởng một loạt. Trịnh Toàn được phong làm Khâm sai Tiết chế thuộc thủy bộ chư doanh, kiêm hành hạ phủ trị Nghệ An đạo, Phó tướng, Thái úy, tước Ninh quốc công; lại được quyền khai phủ, gọi là phủ Dương Uy.
Các quan văn dưới quyền cũng được thăng thưởng. Đốc thị Dương Hồ làm Công bộ Tả thị lang, tước Thọ Lâm bá. Ngô Sĩ Vinh làm Quang Lộc tự khanh, tước Lý Hải hầu. Phan Hưng Tạo làm Thái Bộc tự khanh, tước Thọ Lĩnh hầu. Vũ Vinh Tiến làm Hộ khoa Đô cấp sự trung, tước Lệ Hải tử.
Các tướng dưới quyền cũng được thăng thưởng một loạt. Đào Quang Nhiêu được đề bạt vượt cấp, làm Thiếu bảo. Lê Thì Hiến làm Đô đốc đồng tri. Hoàng Nghĩa Chẩn, Mẫn Văn Liên làm Đô đốc thiêm sự, Đặng Thế Công, Hoàng Nghĩa Giao, Đinh Văn Tả, Lê Văn Tiến, Đào Thế Tiên, Lê Văn Long, Mai Văn Hiếu làm Đề đốc. Tất cả đều được ban tước quận công. Ngô Văn Sĩ, Lê Đăng Nhậm, Lê Công Triều làm Tham đốc.
Ngoài ra còn ban thưởng cho Nguyễn Hữu Tá tước quận công. Dương Quỳnh, Nguyễn Thế Tế, Nguyễn Tiến Kiên làm Thự vệ sự. Truy tặng những người tử trận. Tặng Doãn Năng làm Đô đốc đồng tri, tước Tào quận công, lập đền thờ cúng, cấp cho ruộng tế và dân lộc. Tặng Bùi Sĩ Lương làm Tham đốc, Thọ quận công; Thái Bá Đào làm Thự vệ sự, Diễn quận công; Nguyễn Văn Tú làm Đề đốc, Thông quận công. Họ đều được cấp tự điền, dân lộc và cho phép thờ cúng. Doãn Năng có lẽ chính là Tào Nham. Tư liệu dòng họ cho biết Doãn Năng cùng con trai tử trận ở Triều Khẩu khi giao chiến với quân Nguyễn, nhưng lại ghi nhầm thành năm 1643.
Chúa Trịnh còn xử tội các tướng thủy quân thua trận. Lũng quận công Vũ Văn Thiêm bị biếm làm Hữu đô đốc, Nguyễn Văn Yến bị biếm làm Tham đốc. Cả hai đều bị thu hồi một nửa lộc binh, dân. Nguyễn Hữu Sắc bị bãi hết chức tước. Riêng các viên Lê Sĩ Hậu, Trương Đắc Thọ, Nguyễn Đức Dương, Đỗ Lễ vì cố sức chiến đấu, nhưng quân cô không chống nổi, nên được miễn tội.