Trận Lạc Xuyên quân Nguyễn thu được nhiều khí giới, voi ngựa và thuốc đạn do quân Trịnh vứt lại. Vì đã có lệnh từ trước nên quân Nguyễn tổ chức truy kích tàn quân Trịnh. Thủy quân Nguyễn tiến vào cửa biển Nam Giới. Tướng Trịnh giữ cửa biển này là Nguyễn Hữu Sắc và Lê Sĩ Hậu. Vừa thấy bóng quân Nam, Nguyễn Hữu Sắc liền bỏ chạy. Lê Sĩ Hậu phải vừa đánh vừa rút lui. Quân Nguyễn chiếm được cửa biển. Trịnh Trượng phải chạy thẳng về An Trường, dựa vào sông Lam để thiết lập phòng tuyến. Bộ binh Nguyễn dưới sự dẫn dắt của hàng tướng Đặng Minh Tắc cũng tiến vào xã Bân Xá, huyện Thiên Lộc ở phía Nam sông Lam.
Trịnh Trượng và Vũ Văn Thiêm đem số quân thủy bộ còn lại chia đóng từ núi Nghĩa Liệt tới cửa biển Đan Nhai để phòng bị, một mặt dâng biểu về triều báo tin thua trận.
Trận thảm bại của Trịnh Trượng còn nặng nề hơn Lê Văn Hiểu. Chúa Trịnh Tráng phải phái Thế tử Tây Định vương Trịnh Tạc dẫn quân vào Nghệ An. Tháng Chín cùng năm [1655], Trịnh Tạc đem quân tới An Trường. Việc đầu tiên mà Thế tử làm chính là luận công tội của các tướng trong trận Lạc Xuyên.
Hai tướng La Đức Đại và Nguyễn Hưng Nhượng bị xử trảm. Tạ Thế Bảo bị xử giảo (treo cổ). Trịnh Đá, Lê Hữu Lễ bị bãi chức. Trịnh Trụ bị giáng làm Đô đốc Đồng tri. Xá lại Đỗ Công Khôi, Trần Hữu Tài có nhiệm vụ quan chiến, nhưng lại tư tình, lấy lỗi làm công, nên bị xử chặt ngón tay. Riêng Trịnh Trượng là Thống lĩnh toàn quân lại chẳng thấy trách phạt gì. Bên cánh thủy quân còn được xử nhẹ nhàng hơn. Vũ Văn Thiêm được bổ làm Tả đô đốc. Trương Đắc Thọ được khôi phục tước Trình quận công. Chỉ có Nguyễn Hữu Sắc bị bãi hết chức tước.
Nhưng Thế tử Trịnh Tạc cũng không làm được gì để thay đổi tình hình. Ở Đông Kinh, chúa Trịnh Tráng bàn bạc về chuyện Khê quận công Trịnh Trượng thua trận, thì có một người cao giọng nói:
– Quận Khê là hạng vô mưu, mới khiến bại vong. Thần xin lĩnh quân ruổi dài thẳng tiến, bắt Thuận, Chiêu nạp ở dưới cờ, để tỏ anh hùng.
Chúa Trịnh Tráng trông ra, thì là lão tướng Đô đốc đồng tri Đương quận công Đào Quang Nhiêu (1601 – 1672), bấy giờ đã 54 tuổi. Đào Quang Nhiêu người làng Tuyền Cam huyện Thanh Oai, vốn họ Nguyễn Gia, là con nuôi của công thần Yên quận công Đào Quang Hoa, được tập ấm cha nên được coi quân. Năm 1645, trong loạn Trịnh Lịch và Trịnh Sầm, thì Đào Quang Nhiêu là tướng dẫn quân, đã chém được Trịnh Lịch ngay trong trận.
Chúa Trịnh Tráng bằng lòng, nhưng vẫn cần một người trong dòng họ chúa để chỉ huy tất cả. Ông bèn chọn người con trai nhỏ tuổi là Trịnh Toàn.